新疆农科城拟实行自治区人民政府和科技部、北京、陕西、山东四方共建机制，根据地域和产业布局，按照“一城多园”的思路，把有特色的农业科技园区吸纳为新疆农科城的组成部分，将部分特色鲜明、建设基础较好的新疆农业科技园区纳入科技部的总体战略部署，为下一步发展为国家级农业科技园区奠定基础。
据了解，新疆农科城将采取“三产推动一产”新模式。通过园区结盟，有利于各自园区的农业科技、农副产品相互帮助、相互促进、共同研发。今后，新疆将借新疆农科城建设之机，积极争取各种资源向农业科技园区倾斜，加大投入力度，同时，还将把新疆的国家级和自治区级的农业科技园区有效组织起来，共同促进农业科技园区建设迈上新台阶。
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