水稻年年浸种，秧田期还是年年发生病害，一般多为以下4种情况影响。
1、不是药剂浸种防治对象。
水稻浸种只能是杀灭种子表面病菌，预防稻瘟病，恶苗病等种传病害好，但是像立枯病，绵腐病等土壤传播病害，浸种预防对其就没有效果，即使药剂浸种了，如果秧苗生长期间，低温冷害频繁发生，棚温或水肥管理不当，使苗床ph值过高，秧苗生长过旺，或营养不良根系不好等，加之长期低温寡照天气影响，秧苗抗病性抗逆性差，立枯病等土传病害就会趁机侵染为害发生。因此除浸种外，还有做好苗床消毒处理，并加强秧田期管理，培育壮苗利于减少防止发病。
2、药剂使用不当，防效不好。
像水稻稻瘟病，恶苗病，线虫病及细条病等都是可经由种子带菌引起，但是不同病害有效浸种防止药剂不同，比如稻瘟病一般稻瘟灵或咪鲜胺较好，而恶苗病一般氰烯菌酯最好。其次浸种灵，而细条病一般氯溴异氰尿酸浸种较好。而线虫病则要杀虫双或杀螟松药剂，杀菌剂无效。所以，种子带菌不同，如果选用浸种药剂不对路，就会防效下降或效果不好，进而浸种后也是会再次发病。
3、抗药性增强。
据监测，因长期用咪鲜胺浸种预防稻瘟病，兼防恶苗病，使病害抗药性增强，尤其恶苗病像在东北江苏用咪鲜胺浸种已经达到无效境界了，其它多数地区也效果明显下降。同样，如果一个地区长期使用一种药剂进行浸种时，也会导致效果下降，防效不好，如果在管理不当，秧苗素质不好，抗病性抗逆性下降时，就会容易使病害再次侵染发生。
4、浸种药剂用量低。
比如咪鲜胺一般2500-3000有效，而氰烯菌酯多1500-4000倍液效果较好，如果稀释浓度大，药剂用量过少时，即使浸种，对病菌效果不好，田间温湿度适宜时也会造成再次发病为害。同样浓度过大会造成药害影响生长。
总之，药剂浸种对种传病害可以达到事半功倍效果，但也要根据病虫害发生种类选用好对路药剂，避免抗药性影响效果，并保持适宜药剂浓度，同时加强秧田期管理，提高秧苗素质，增强抗逆性抗病性，才能有效减少预防病害侵染发生。
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